Chromosoomafwijkingen komen zeer vaak voor in vroege menselijke IVF-embryo's en worden beschouwd als de belangrijkste oorzaak van implantatiefalen en miskraam. Huidige detectiemethoden zoals massive parallel sequencing (MPS) zijn snel en eenvoudig, maar kunnen niet het volledige spectrum van chromosoomafwijkingen vastleggen. Bijvoorbeeld, haploïdie, triploïdie en uniparentale disomie (UPD) zijn niet detecteerbaar en meiotische en mitotische trisomieën kunnen niet worden onderscheiden. Andere methoden, gebaseerd op haplotyping (chromosomen traceren van generatie op generatie), kunnen worden gebruikt om deze anomalieën te detecteren, maar grootschalige toepassing is moeilijk omdat deze methoden DNA vereisen van familieleden van de toekomstige ouders.
In deze context biedt de VUB-onderzoeksgroep Reproductie & Genetica een nieuwe en innovatieve methode genaamd 'Analysis of Parental Contribution for Aneuploidy Detection' of 'APCAD' om alle soorten chromosoomafwijkingen te detecteren en te kwantificeren door de proportie van maternale (en dus paternale) kopieën voor elk chromosoom in een embryonaal monster te berekenen. Door de detectie van chromosoomaantal (CN) en de proportie maternale kopieën (%Mat) te combineren via APCAD, kan men alle soorten chromosoomafwijkingen onderscheiden, onafhankelijk van haplotyping.
In tegenstelling tot de huidige methoden, kan APCAD het volledige spectrum van chromosoomafwijkingen detecteren, inclusief haploïdie, polyploïdie en kopie-aantal-neutrale anomalieën (UPD). APCAD garandeert een nauwkeurigere detectie van aneuploïdie dan eenvoudige op kopie-aantal gebaseerde methoden. Bovendien maakt APCAD gebruik van alleen DNA-monsters van het toekomstige ouderpaar – zonder dat monsters van familieleden nodig zijn – en kan het mozaïcisme onderscheiden van complete afwijkingen, maternale van paternale en mitotische van meiotische kopie-aantalafwijkingen. Daarnaast kan de analyse bevestigen dat de gameten van de toekomstige ouders zijn gebruikt.
Publicatie: APCAD: a new method for detection of aneuploidy and mosaicism in preimplantation embryos, geaccepteerd voor publicatie in Reproductive BioMedicine Online. Lees hier.
Octrooiaanvraag in behandeling door Vrije Universiteit Brussel, getiteld "METHOD FOR THE ANALYSIS OF GENETIC MATERIAL", gepubliceerd als WO2021/180722. Klik hier.
Duik in het onderzoeksportaal en ontdek alle mogelijkheden.
